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玉溪农业职业技术学院前身是始建于1956年的玉溪农业学校。1991年，经省教委评估认定为“合格中专学校”；1993年，被省政府认定为“省部级重点中专学校”，同年省政府批准建立“云南省玉溪烟草栽培学校”；2000年，首批步入国家级重点中专行列；2002年，学校升格为高职院校，成为玉溪市唯一一所以举办职业技术教育为主的全日制普通高等学校，同年开始招收大专生；2006年，学院通过国家教育部第一轮人才培养工作水平的评估；2012年，通过国家教育部第二轮人才培养工作评估。

学院占地216.9亩，拥有45个校内实训实验室、2个校内农场、1个养殖场，49个校外实训基地，多媒体教室48间，座位数3184个。教学行政用房3.3万平方米，教学科研仪器设备1427.2万元，图书馆藏书37.2万册，其中电子图书20万册，学生宿舍2.7万平方米。

学院有教职工243人，其中专任教师148人，校内兼职教师59人，具有副高以上职称56人，中级职称100人；博士、硕士学位79人；“双师素质”教师107人；省级教学名师1人，省级教学团队1个；国家级咨询师8人。

近三年来，我院教师主编、参编教材33本，《园艺植物保护》被列为云南省十二.五规划教材建设立项项目；《茶艺》、《园林规划设计》两门课程被评为省级精品课程，11门课程被评为院级精品课程。学院积极与企业合作开发课程，将国家标准、职业资格标准、地方标准等引入课程；烟草栽培技术专业与云南省烟草科学研究院合作编写了《烟叶分级》、《烟草病虫害防治》、《烟草遗传育种》、《烟叶化学成分分析》等教材。

学院下设农林、园艺、动物科学、农业经济管理、计算机信息科学5个系和基础部，开设烟草栽培技术、园艺技术、畜牧兽医、会计（财务会计）、室内设计技术等34个高职专业（含专业方向）;同时兼招五年制专科（11个专业）与中专。

2007年，学院园艺技术专业实训基地建设获得了中央财政300万元支持；2008年，学院被省教育厅评为“云南省高校教学管理先进单位”，烟草栽培技术专业校外实训基地被评为省级示范性实训教学基地；2009年，畜牧兽医专业校外实训基地被评为省级示范性实训教学基地；2010年，学院被云南省高职高专分会评为“云南省职业教育先进集体”；2011年，被玉溪市教育局评为“教育科研工作先进集体”；2012年，烟草栽培技术专业获中央财政“高等职业学校提升专业服务产业发展能力”项目支持；学院教务处被省教育厅评为“云南省高等学校教学管理工作先进集体”，在云南省“联想杯”大学生计算机设计大赛专科组比赛中，获得了团体一等奖和组织奖。