阿米巴病是由溶组织阿米巴原虫所引起。阿米巴有包囊和滋养体两个不同时期，其中包囊是传染根源，而滋养体可侵入肠壁及肠外组织，引起阿米巴痢疾和肠外阿米巴病，如阿米巴肝、肺或脑阿米巴脓肿等。
抗阿米巴病药物对滋养体具有杀灭作用，少数药物还具有杀灭包囊作用，某些抗生素，如巴龙霉素等可直接杀灭滋养体或抑制共生菌群，而发挥抗阿米巴病作用。
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